“十二五”深化医药卫生体制改革明确将信息化建设作为建立基本医疗卫生制度的重要技术支撑。从公立医院改革、等级评审到电子病历系统应用水平评价，政策重心正系统性聚焦于县级医院的能力提升与业务整合，推动医疗服务网络由单体机构向县域健康一体化协同转型。
深化医药卫生体制改革是贯彻落实科学发展观、加快转变经济发展方式的重大实践，是建设现代国家、保障和改善民生、促进社会公平正义的重要举措，也是贯穿经济社会领域的一场综合改革。“十二五”时期是深化医药卫生体制改革的攻坚阶段，也是建立基本医疗卫生制度的关键时期。
“十二五”深化医改规划
中共中央国务院《关于深化医药卫生体制改革的意见》（中发〔2009〕6号，以下简称《意见》）中提出，深化医药卫生体制改革的总体目标为建立健全覆盖城乡居民的基本医疗卫生制度，为群众提供安全、有效、方便、价廉的医疗卫生服务。文件明确提出了建立基本医疗卫生制度的“四梁八柱”构架，信息系统建设第一次成为医药卫生体制改革的一个重要环节和唯一的技术支撑。
自2009年4月深化医药卫生体制改革启动实施以来，在党中央、国务院领导下，各地区、各有关部门认真贯彻落实中央的决策部署，按照保基本、强基层、建机制的基本原则，完善政策、健全制度、加大投入，统筹推进五项重点改革，取得了明显进展和初步成效，实现了阶段性目标。覆盖城乡的基层医疗卫生服务体系基本建成，2200多所县级医院和3.3万多个城乡基层医疗卫生机构得到改造完善，中医药服务能力逐步增强，全科医生制度建设开始启动。基本公共卫生服务均等化水平不断提高，10类国家基本公共卫生服务面向城乡居民免费提供，国家重大公共卫生服务项目全面实施。公立医院改革试点积极推进，围绕政事分开、管办分开、医药分开、营利性和非营利性分开（以下简称“四个分开”）进行体制机制创新，便民惠民措施全面推开，多元办医稳步推进。各级政府对医药卫生工作的认识和执行力明显提高，实践经验和做法不断丰富，支持医药卫生体制改革的社会氛围正在形成。
到2011年，基本医疗保障制度全面覆盖城乡居民，基本药物制度初步建立，城乡基层医疗卫生服务体系进一步健全，基本公共卫生服务得到普及，公立医院改革试点取得突破，明显提高基本医疗卫生服务可及性，有效减轻居民就医费用负担，切实缓解“看病难、看病贵”问题。
在国家《“十二五”期间深化医药卫生体制改革规划暨实施方案》（国发〔2012〕11号）中，指出总体要求为：坚持把基本医疗卫生制度作为公共产品向全民提供的核心理念，坚持保基本、强基层、建机制的基本原则，坚持预防为主、以农村为重点、中西医并重的方针，以维护和增进全体人民健康为宗旨，以基本医疗卫生制度建设为核心，统筹安排、突出重点、循序推进，进一步深化医疗保障、医疗服务、公共卫生、药品供应以及监管体制等领域综合改革，着力在全民基本医保建设、基本药物制度巩固完善和公立医院改革方面取得重点突破，增强全民基本医保的基础性作用，强化医疗服务的公益性，优化卫生资源配置，重构药品生产流通秩序，提高医药卫生体制的运行效率，加快形成人民群众“病有所医”的制度保障，不断提高全体人民健康水平，使人民群众共享改革发展的成果。
《方案》中还明确提出了县级医院建设的一系列要求和措施：坚持公立医院公益性质，按照“四个分开”的要求，以破除“以药补医”机制为关键环节，以县级医院为重点，统筹推进管理体制、补偿机制、人事分配、药品供应、价格机制等方面的综合改革，由局部试点转向全面推进，大力开展便民惠民服务，逐步建立维护公益性、调动积极性、保障可持续的公立医院运行新机制。
公立医院综合改革
为贯彻落实《意见》精神，卫生部专门发布了《关于公立医院改革试点的指导意见》（卫医管发〔2010〕20号）。要求坚持公立医院的公益性质，把维护人民健康权益放在第一位，实行政事分开、管办分开、医药分开、营利性和非营利性分开，推进体制机制创新，调动医务人员积极性，提高公立医院运行效率，努力让群众看好病。按照“适度规模、优化结构、合理布局、提高质量、持续发展”的要求，坚持中西医并重方针，统筹配置城乡之间和区域之间医疗资源，促进公立医院健康发展，满足人民群众基本医疗服务需求，切实缓解群众看病贵、看病难问题。
2010年开始推进完善公立医院服务体系、改革公立医院管理体制、改革公立医院法人治理机制、改革公立医院内部运行机制、改革公立医院补偿机制、加强公立医院管理、改革公立医院监管机制、建立住院医师规范化培训制度、加快推进多元化办医格局等九个方面的公立医院改革试点工作。加强对试点城市的调研督导，及时研究解决存在的问题，加强信息交流和指导培训，适时开展评估工作。不断总结公立医院改革试点工作经验，完善公立医院改革总体思路和主要政策措施，在全国逐步推进公立医院改革。
在国家《关于县级公立医院综合改革试点的意见》（国办发〔2012〕33号）中提出按照保基本、强基层、建机制的要求，遵循上下联动、内增活力、外加推力的原则，围绕政事分开、管办分开、医药分开、营利性和非营利性分开的改革要求，以破除“以药补医”机制为关键环节，以改革补偿机制和落实医院自主经营管理权为切入点，统筹推进管理体制、补偿机制、人事分配、价格机制、医保支付制度、采购机制、监管机制等综合改革，建立起维护公益性、调动积极性、保障可持续的县级医院运行机制。坚持以改革促发展，加强以人才、技术、重点专科为核心的能力建设，统筹县域医疗卫生体系发展，力争使县域内就诊率提高到90%左右，基本实现大病不出县。
全程电子病历与应用水平分级评价
根据国家卫生部办公厅于2009年12月发布的《电子病历基本架构与数据标准（试行）》，电子病历被定义为医疗机构对门诊、住院患者（或保健对象）临床诊疗和指导干预的、数字化的医疗服务工作记录，是居民个人在医疗机构历次就诊过程中产生和被记录的完整、详细的临床信息资源，而不仅仅限于临床电子文书内容。
电子病历贯穿整个医疗过程，完整集中地记录了各种医疗服务者下达的医疗指令及执行结果，并被诊疗过程的各个环节使用，具有高度的共享性，是医院信息系统的核心。
《电子病历基本架构与数据标准（试行）》的制订为临床信息系统的发展指明了方向。基于电子病历的临床信息系统与传统局限于某个特定职能科室或特定专业领域的系统不同，它是贯穿完整诊疗过程的一系列临床信息系统的有机整体。系统以促进临床质量的持续改进为目标，分别以病人为中心提出业务需求，以电子病历为核心提出数据需求，以临床医师诊疗为基础提出功能需求。
为保证我国以电子病历为核心的医院信息化建设工作顺利开展，逐步建立适合我国国情的电子病历系统应用水平评估和持续改进体系，卫生部在2011年制定了电子病历系统应用水平分级评价方法和标准。
根据电子病历的功能状态、适用范围及基础环境，评价体系依据医疗工作流程中的9个角色与37个评价项目，将电子病历系统应用水平划分为8级。
根据卫生部县级医院能力建设方案，县级医院的电子病历应用水平需要达到中级水平（即4级或5级），实现全院电子医嘱与费用管理；并在此基础上建设一体化医院信息平台，实现全院应用系统的互联互通、数据整合和信息共享。
医院等级评审机制
随着2011年新一轮医院等级评审工作的启动，对县级医院通过医院功能任务、医院服务、患者安全目标、医疗质量安全管理和持续改进、护理管理与质量持续改进、医院管理等六个方面共321条标准进行评审，通过35条监测指标对二级综合医院的日常运行、医疗质量与安全指标进行监测与评审后的追踪评价，对县级医院的服务与管理能力提出了更高要求。
同时，医院等级评审作为一项常态化管理工作持续开展，医院每三年需要重新参加省级卫生主管部门组织的等级评审复审，以制度化机制促进医院管理的持续改进。
医疗服务与卫生健康一体化
《中共中央国务院关于深化医药卫生体制改革的意见》指出，进一步健全以县级医院为龙头、乡镇卫生院和村卫生室为基础的农村医疗卫生服务网络。县级医院作为县域内的医疗卫生中心，主要为县域居民提供基本医疗服务，包括运用适宜医疗技术和药物，开展常见病、多发病诊疗，危急重症病人救治，重大疑难疾病接治转诊；推广应用适宜医疗技术，为农村基层医疗卫生机构人员提供培训和技术指导；承担部分公共卫生服务，以及自然灾害和突发公共卫生事件医疗救治等工作。
县医院是我国省、市、县城市三级医疗卫生服务网的基础，又是农村三级医疗卫生服务网的龙头，是与广大农村地区群众关系最为密切的公立医院，在我国医疗服务体系中起着承上启下的重要作用。县医院需要充分发挥医疗服务与卫生健康协同的双重定位，加强对基层医疗卫生机构的技术帮扶指导和人员培训，探索建立县级医院向乡镇卫生院轮换派驻院长和骨干医师制度，通过开展纵向技术合作、人才流动、管理支持等多种形式，提高农村医疗卫生服务体系整体效率，形成优质医疗资源流动的长效机制，使一般常见病、慢性病、康复等患者下沉到基层医疗卫生机构，逐步形成基层首诊、分级医疗、双向转诊的医疗服务模式。支持县级医院对乡镇卫生院和村卫生室医务人员进行专项培训和定期轮训；县级医院亦需与城市三级医院建立危重病例远程会诊、重大疑难病例转诊等协同机制。
各项政策表明，县级医院能力建设在深化医改中处于战略枢纽位置。县级医院服务能力不强、质量不高，在很大程度上导致常见病患者流向城市大医院，加剧三级医院拥挤并抬升群众就医负担。提高县级医院服务能力，建立县级医院与基层医疗卫生机构、城市三级医院长期稳定的分工协作机制，是联结医改各项重点任务的关键纽带。深入贯彻落实医改决策部署，坚持“保基本、强基层、建机制”的基本原则，建立维护公益性、调动积极性、保障可持续的运行机制，是实现“大病不出县”并让改革成果惠及群众的根本路径。